瘟神信仰的產生與早期福州發生過大小規模瘟疫不計其數，醫者幾乎束手無策，人們藉種瘟神信仰來消災解厄。流傳馬祖的瘟神故事為「五書生投井收毒」，福州居民為感念五書生的義舉，建「靈公祠」悼念，地方官奏報朝廷設封，敕封為五福大帝。而馬祖瘟神廟眾多，雖名稱上有差異，包括五靈公、五顯公（大帝）、五福大帝、五帝爺等，神龕裡通常供奉五尊神祉，面目表情和顏色殊異，皆屬於「閩東福州五帝系統」瘟神。

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馬祖五靈公信仰隨移民遍布各島，轉換成地方的鄉土神，在南竿牛峰境五靈公廟，北竿的塘岐、橋仔、芹壁和西莒田沃供俸為主祀神，並於南竿山隴、福澳，東莒的福正和大浦等廟宇以陪祀神祭祀。